Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NELFCDQ8IXH7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NELFCDQ8IXH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NELFCDQ8IXH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms