Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL3Q8IVW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKL3Q8IVW4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKL3Q8IVW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms