Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNJLQ8IV13 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNJLQ8IV13 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJLQ8IV13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms