Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSIG1Q86XK7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSIG1Q86XK7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms