Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
N4BP2Q86UW6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
N4BP2Q86UW6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
N4BP2Q86UW6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
N4BP2Q86UW6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
N4BP2Q86UW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms