Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG4DQ86TL0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG4DQ86TL0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG4DQ86TL0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms