Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC6BQ86SZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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