Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLNKQ7Z7G1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNKQ7Z7G1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms