Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YTHDF3Q7Z739 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YTHDF3Q7Z739 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDF3Q7Z739 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms