Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE3BQ7Z3V4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE3BQ7Z3V4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE3BQ7Z3V4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms