Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRADAQ7RTN6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
STRADAQ7RTN6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms