Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM5Q71RC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMIM5Q71RC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMIM5Q71RC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms