Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CYS1Q717R9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYS1Q717R9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms