Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2R2Q712K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2R2Q712K3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms