Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS12Q6ZW61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBS12Q6ZW61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS12Q6ZW61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms