Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO4C1Q6ZQN7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLCO4C1Q6ZQN7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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