Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZRN4Q6ZMN7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms