Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKN3Q6P5Z2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKN3Q6P5Z2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms