Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMBOX1Q6NT76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMBOX1Q6NT76 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms