Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD40Q6AI12 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD40Q6AI12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ANKRD40Q6AI12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms