Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN13Q68D06 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN13Q68D06 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN13Q68D06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms