Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L1Q676U5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG16L1Q676U5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms