Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG9BQ674R7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms