Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE2Q659A1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE2Q659A1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE2Q659A1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms