Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHEQ5VZ18 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHEQ5VZ18 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms