Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCERG1LQ5VWI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCERG1LQ5VWI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCERG1LQ5VWI1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms