Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
EFCAB2Q5VUJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EFCAB2Q5VUJ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
EFCAB2Q5VUJ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms