Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF17Q5VTA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF17Q5VTA0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms