Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFFO2Q5TF58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFFO2Q5TF58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFFO2Q5TF58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms