Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf220Q5T0J3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf220Q5T0J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf220Q5T0J3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms