Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms