Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C10orf55Q5SWW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms