Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX1Q5SQQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX1Q5SQQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX1Q5SQQ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms