Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTSL3PQ5NE16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSL3PQ5NE16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSL3PQ5NE16 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms