Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYCQ5MJ68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYCQ5MJ68 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms