Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL4Q5MAI5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDKL4Q5MAI5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL4Q5MAI5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms