Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCID2Q5JVF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCID2Q5JVF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms