Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPIN3Q5JUX0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPIN3Q5JUX0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms