Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPM1JQ5JR12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPM1JQ5JR12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1JQ5JR12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms