Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C3orf38Q5JPI3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C3orf38Q5JPI3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C3orf38Q5JPI3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms