Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRB2Q5IJ48 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms