Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC4Q5GLZ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC4Q5GLZ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC4Q5GLZ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms