Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TDRD12Q587J7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD12Q587J7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD12Q587J7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms