Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO2Q562F6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO2Q562F6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms