Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TPRNQ4KMQ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPRNQ4KMQ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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