Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GNPTABQ3T906 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GNPTABQ3T906 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GNPTABQ3T906 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms