Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTLL9Q3SXZ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTLL9Q3SXZ7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms