Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms