Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HKDC1Q2TB90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HKDC1Q2TB90 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HKDC1Q2TB90 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms