Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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